Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
EP300Q09472 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
EP300Q09472 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms