Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA3Q08378 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA3Q08378 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms