Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNB2Q08289 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNB2Q08289 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms