Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPP3CAQ08209 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms