Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4BQ07343 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms