Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX4Q06945 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms