Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GABPAQ06546 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms