Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms