Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TPTEP56180 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TPTEP56180 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TPTEP56180 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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