Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms