Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCLMP48507 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms