Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATRXP46100 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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