Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MAP2K4P45985 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms