Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACADSBP45954 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms