Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTHFRP42898 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms