Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA2P42262 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms