Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDIT3P35638 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms