Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNA1P35221 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms