Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CXCR5P32302 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCR5P32302 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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