Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LMO2P25791 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms