Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FGFR4P22455 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FGFR4P22455 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms