Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NFKB1P19838 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms