Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM10L2BP0DMW5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms