Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYBBP04839 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms