Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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