Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms