Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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