Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RGPD3A6NKT7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms