Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP8A1Q9Y2Q0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms