Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTF2Q9UNY4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms