Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms