Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D2AQ9P2K1 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms