Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGSF9Q9P2J2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms