Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCNT4Q9P109 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCNT4Q9P109 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms