Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIPL1Q9NZN9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIPL1Q9NZN9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms