Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA4BQ9NPR2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEMA4BQ9NPR2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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