Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKD2Q9BZL6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms