Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP4-3Q9BYR4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP4-3Q9BYR4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP4-3Q9BYR4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP4-3Q9BYR4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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