Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms