Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACAP3Q96P50 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms