Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HIC2Q96JB3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms