Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TTC28Q96AY4 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms