Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHIPQ8WWQ0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms