Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLC22A9Q8IVM8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms