Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CATSPER4Q7RTX7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CATSPER4Q7RTX7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms