Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM208BQ5VWN6 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM208BQ5VWN6 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FAM208BQ5VWN6 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM208BQ5VWN6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM208BQ5VWN6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FAM208BQ5VWN6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM208BQ5VWN6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM208BQ5VWN6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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