Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms