Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR44Q5JSH3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms