Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFT2D3Q587I9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms