Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLHL22Q53GT1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms